在（中）里提到商鞅立木建信，在此时，太子触犯了法律，商鞅说：“新法不能顺利施行，就在于上层人士带头违犯。太子是国君的继承人，不能施以刑罚，便将他的老师公子虔处刑割掉鼻子，在另一个老师公孙贾的脸上刺字，以示惩戒。”第二天，秦国人听说此事，都遵从了法令。
商鞅的变法不是缓慢实行让民众逐渐接受的，而是暴戾的手法迅速推行。刚开始，严苛的变法引起了很多贵族、百姓的抱怨以及不满，面对这样的情况，商鞅采取从重、从快的处置方式，他将国家暴力机构作为自己的后盾，大肆抓捕并处决反对派。商鞅的这种处置方式并不仅仅针对反对派，对那些刚开始不认可新法，尝到甜头后改口说好的人，商鞅也是毫不留情，他将这些人抓捕起来流放至边疆。商鞅认为民众就应该像机器一般执行国家颁布的法令，民众不应该对国家政策进行评判，民众能够自己独立思考是一件能够危害到国家稳定的事情，因此无论是反对还是支持，这些人都应该受到严厉的惩罚。
秦民初言令不便者有来言令便者，卫鞅曰“此皆乱化之民也”，尽迁之於边城——《史记·商君列传》
公元前年，秦国迁都咸阳，商鞅开始了第二次变法：
废井田，开阡陌，承认土地私有
普遍推行县制，设置县一级的官僚机构（此举将全国的政权、兵权集中到了朝廷，建立起中央集权的政治体制）
统一度量衡制，颁布度量衡的标准器
按户按人口征赋（自此“田租”土地税和“口赋”人头税就成为中国古代社会两种重要的赋税制度）
革除残留的戎狄风俗，禁止父子兄弟同室居住
从商鞅被任命为主持变法的左庶长到秦孝公去世的十九年间，秦国如同秦孝公和商鞅所规划的那样在西侧崛起，击败了魏国，还把秦国的领土向东拓展了许多。公元前年，商鞅获封于商十五邑，被称为商君。到此，商鞅的事业达到了顶峰。
在商鞅如日中天的时候，有一个叫作赵良的人去拜访他，刚见面的时候，赵良就拒绝了商鞅提出的两人交友的建议，他随后还像商鞅明确指出：但商鞅没有听从赵良的劝告。
相秦不以百姓为事，而大筑冀阙，非所以为功也。刑黥太子之师傅，残伤民以骏刑，是积怨畜祸也。教之化民也深於命，民之效上也捷於令。今君又左建外易，非所以为教也——《史记·商君列传》
君尚将贪商於之富，宠秦国之教，畜百姓之怨，秦王一旦捐宾客而不立朝，秦国之所以收君者，岂其微哉？亡可翘足而待。”商君弗从。——《史记·商君列传》
任何的变法或改革的过程中都必然会伤害到既得利益者的权益。商鞅变法的核心之一是军功爵制：该制度目的在于打击旧贵族，激活秦国的军队，但这势必引起贵族势力的不满。商鞅认为只要能达到目的，手段可以无所不用其极，对老百姓是这样，王公贵族也是，甚至太子也是。
公元前年，秦孝公逝世，太子嬴驷继位也就是秦惠文王，商鞅权力的基础是秦孝公。如今秦孝公去世，商鞅失去了倚靠的人，被旧贵族势力诬告谋反，列举大小罪名数十种。同年，商鞅被实施以酷刑，五马分尸而亡。
商君归还，惠王车裂之，而秦人不怜——《战国策·卫鞅亡魏入秦》
之后的秦惠文王虽憎恨商鞅，但还是继续推行其变法...
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